ProyectosAño de inicioPeriodoLínea
Tarazona Campos, Sonia. Statistical and machine learning techniques in human microbiome studies (CA18131). (22/02/19 - 21/02/23).Otras acciones de I+D competitivas. Comisión europea. 201922/02/19 - 21/02/23 L6
Tarazona Campos, Sonia (I.P.). Nuevos Metodos para los Retos Emergentes en el Analisis de Datos de Secuenciacion Masiva (BIO2015-71658-R). (07/01/19 - 07/10/19).Investigación competitiva proyectos. MINISTERIO DE ECONOMIA Y EMPRESA. 201907/01/19 - 07/10/19 L6
Tarazona Campos, Sonia; Arzalluz-Luque, Ángeles. Ayudas para Contratos Predoctorales para la Formacion de Doctores-Arzalluz Luque (BES-2016-076994). (01/05/19 - 01/05/21).Financiación RRHH. AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACION. 201901/05/19 - 01/05/21 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. Plataforma de Bionformática (PT17/0009/0015). (01/01/18 - 31/12/20).Proyectos de investigación. Ministerio de Economía y Competitividad (Instituto de Salud Carlos III). 201801/01/18 - 31/12/20 L6
A. Conesa (I.P.); Ferrer, Alberto; Tarazona Campos, Sonia; Prats-Montalbán, José Manuel. The Next Systems Biology: desarrollo de métodos estadísticos para la biología de sistemas multiómica (PROMETEO GRUPOS DE EXCELENCIA). (01/01/16 - 31/12/19).Proyectos de investigación con coordinador. Generalitat Valenciana. 201601/01/16 - 31/12/19 L6
Tarazona Campos, Sonia (I.P.). Nuevos métodos para los retos emergentes en el análisis de datos de secuenciación masiva (BIO2015-71658-R). (01/01/16 - 31/12/18).Proyectos de investigación. Ministerio de Economía y Competitividad. 201601/01/16 - 31/12/18 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. DEANN: Developing an European American NGS Network (612583 IRSES). (01/01/14 - 31/12/17).Proyectos europeos del programa Marco. Comisión Europea. 201401/01/14 - 31/12/17 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. Desarrollo de recursos computacionales para la caracterización y anotación funcional de ARN no codificante (BIO2012-40244). (01/01/13 - 31/12/15).Proyectos de investigación. Ministerio de Economía y Competitividad. 201301/01/13 - 31/12/15 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. Análisis de gemelos discordantes para investigar la correlación entre alteraciones en expresión y metilación de DNA en Lupus eritematoso sistémico (16ER). (26/10/12 - 25/10/13).Proyectos de investigación. Fundación Gent per Gent. 201226/10/12 - 25/10/13 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. Genómica y transcriptómica de las rutas de detoxificación en Drosophila (PIBAR-00266). (26/07/12 - 24/09/14).Proyectos de investigación. Ministerio de Eduación y Ciencia. 201226/07/12 - 24/09/14 L6
Ana Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia; Hernandez-De Diego, Rafael; David Gómez-Cabrero; Jesper Tegner. STATegra: User-driven Development of Statistical Methods for Experimental Planning, Data Gathering and Integrative Analysis of Next Generation Sequencing, Proteomics and Metabolomics (306000). (01/10/12 - 30/09/15).Proyectos europeos del programa Marco. COMISIÓN EUROPEA FP7-HEALTH. 201201/10/12 - 30/09/15 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. Estudio de nuevas relaciones genoma-transcriptoma mediante técnicas de ultra-secuenciación (BIO2009-10799). (01/01/10 - 31/12/12).Proyectos de investigación. Ministerio de Eduación y Ciencia. 201001/01/10 - 31/12/12 L6
A. Conesa (I.P.); Tarazona Campos, Sonia. PathoGenoMics: Transcriptional networks controlling virulence in filamentous fungan pathogens (BIO2008-04638-E). (01/02/09 - 30/01/12).Proyectos de investigación. Ministerio de Eduación y Ciencia. 200901/02/09 - 30/01/12 L6

ArtículosAñoLínea
A. Conesa; José M. Prats-Montalbán; Sonia Tarazona; María José Nueda; Alberto Ferrer. (2010) A multiway approach to data integration in systems biology based on Tucker3 and N-PLS. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 14, 101 - 111. 2010 L6
Ana Conesa; Pedro Madrigal; Tarazona Campos, Sonia; David Gómez-Cabrero; Alejandra Cervera; Andrew McPherson ... Ali Mortazavi. (2016) A survey of best practices for RNA-seq data analysis. Genome Biology, 13 (17), - . Arroyo-Crespo; Armiñán, Ana; Charbonnier; Balzano-Nogueira; Huertas-López; Marti, C. ... Maria Jesus Vicent Docon. (2018) Tumor microenvironment-targeted poly-L-glutamic acid-based combination conjugate for enhanced triple negative breast cancer treatment. Biomaterials - . 2018 L6
Delaye; Ruiz Ruiz, Susana; Calderon; Tarazona Campos, Sonia; A. Conesa; Andrés Moya . (2018) Evidence of the Red-Queen hypothesis from accelerated rates of evolution of genes involved in biotic interactions in Pneumocystis. Genome Biology and Evolution - . 2018 L6
Diego N De Panis; Julián Padró; Furió-Tarí, Pedro; Tarazona Campos, Sonia; Pablo S Milla Carmona; Ignacio M Soto ... Esteban Hasson. (2016) Transcriptome modulation during host shift is driven by secondary metabolites in desert Drosophila. Molecular Ecology, 18 (25), 4534 - 4550. 2016 L6
Fernando; Konstantine; Carbonell Caballero, José; Luis Miguel; Stefan Goetz; Tarazona Campos, Sonia ... Ana. (2012) Qualimap: evaluating next generation sequencing alignment data . Bioinformatics, 2 (28), 2678 - 2679. 10.1093/bioinformatics/bts503 Ferreiros-Vidal; Carroll; Zhang; Lagani; Ramirez; Ing-Simmons ... Noori. (2019) Feedforward regulation of Myc coordinates lineage-specific with housekeeping gene expression during B cell progenitor cell differentiation. PLoS Biology - . 2019 L6
Furió-Tarí, Pedro; Ana Conesa; Tarazona Campos, Sonia. (2016) RGmatch: matching genomic regions to proximal genes in omics data integration. BMC Bioinformatics (17)1293 - . 10.1186/s12859-016-1293-1 2016 L6
Furió-Tarí, Pedro; Tarazona Campos, Sonia; Toni Gabaldón; Anton J. Enright; Ana Conesa. (2016) spongeScan: A web for detecting microRNA binding elements in lncRNA sequences. Nucleic Acids Research - . 10.1093/nar/gkw443 Hernandez-De Diego, Rafael; Tarazona Campos, Sonia; Carlos Martínez-Mira; Balzano-Nogueira; Furió-Tarí, Pedro; Pappas Jr; A. Conesa. (2018) PaintOmics 3: a web resource for the pathway analysis and visualization of multi-omics data. Nucleic Acids Research - . 2018 L6
Hervás-Marín, David; Prats-Montalbán, José Manuel; Garcia-Cañaveras, J.C. ; Lahoz Rodríguez, Agustín Gerardo; Ferrer, Alberto. (2019) Sparse N-way Partial Least Squares by L1-penalization. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems (185)85 - 91. 10.1016/j.chemolab.2019.01.004 2019 L6
Hervás-Marín, David; Prats-Montalbán, José Manuel; Lahoz Rodríguez, Agustín Gerardo; Ferrer, Alberto. (2018) Sparse N-way partial least squares with R package sNPLS. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems (179)54 - 63. 10.1016/j.chemolab.2018.06.005 2018 L6
Ignacio; María José Nueda; Tarazona Campos, Sonia; Götz, Stefan; David; J.S. ... Ana Conesa. (2014) Pathway network inference from gene expression data. BMC Systems Biology, 2 (8), 1 - 17. Irmer; Tarazona Campos, Sonia; Sasse; Olbermann; Loeffler; Krappmann ... Braus. (2015) RNAseq analysis of Aspergillus fumigatus in blood reveals a just wait and see resting stage behavior. BMC Genomics - . 2015 L6
José Manuel Prats-Montalbán; Fernando López-García; José M. Valiente; Alberto Ferrer. (2008) Multivariate statistical projection methods to perform robust feature extraction and classification in surface grading. Journal of Electronic Imaging, 3 (17), 311061 - 3110610. 2008 L6
María José Nueda; Alberto Ferrer; Ana Conesa. (2012) ARSyN: a method for the identification and removal of systematic noise in multifactorial time-course microarray experiments. Biostatistics, 3 (13), 553 - 566. 10.1093/biostatistics/kxr042 María José Nueda; Jordi Martorell; Marti Ibañez, Maria Cristina; Tarazona Campos, Sonia; Ana Conesa. (2017) Identification and visualisation of differential isoform expression in RNA-seq time series. Bioinformatics (btx578) - . 2017 L6
María José Nueda; Sonia Tarazona; Joaquín Dopazo; Alberto Ferrer; Ana Conesa. (2009) Functional Assessment of Time Course Microarray Data. BMC Bioinformatics, 6 (1), 1 - 18. 10.1186/1471-2105/10/S6/S9 2009 L6
María José Nueda; Tarazona Campos, Sonia; Ana Conesa. (2014) Next maSigPro: updating maSigPro Bioconductor package for RNA-seq time series . Bioinformatics, 18 (3), 2598 - 2602. Sebastián-León, Patricia; Enrique; Pablo; Ana Conesa; Tarazona Campos, Sonia; Alicia ... Joaquín Dopazo. (2014) Understanding disease mechanisms with models of signaling pathway activities. BMC Systems Biology0 - 0. 2014 L6
Sonia Prado-López; A. Conesa; Armiñán, Ana; Magdalena Martínez-Losa; Escobedo-Lucea; Gandía, Carolina ... Stojkovic. (2010) Hypoxia promotes efficient differentiation of human embryonic stem cells to functional endothelium. Stem Cells1 - 18. 10.1002/stem.295 2010 L6
Tarazona Campos, Sonia; Elena Bernabeu; Héctor Carmona; Belén Gómez-Jiménez; Javier García-Planells; Pim E. G. Leonards ... Llansola, Marta. (2019) A Multiomics Study To Unravel the Effects of Developmental Exposure to Endosulfan in Rats: Molecular Explanation for Sex-Dependent Effects. ACS Chemical Neuroscience - . 2019 L6
Tarazona Campos, Sonia; Fernando; Joaquín Dopazo; Alberto Ferrer; Conesa, A.. (2011) Differential expression in RNA-seq: A matter of depth. Genome Research, 12 (21), 2213 - 2223. 10.1101/gr.124321.111 Tarazona Campos, Sonia; Furió-Tarí, Pedro; María José Nueda; Ferrer, Alberto; Ana Conesa. (2015) Data quality aware analysis of differential expression in RNA-seq with NOISeq R/Bioc package. Nucleic Acids Research - . 10.1093/nar/gkv711 Tarazona Campos, Sonia; Sánchez-Gaya; Casaní-Galdón; Ugidos-Guerrero, Manuel; Kuang; Mellor; A. Conesa. (2018) Elucidating the Role of Chromatin State and Transcription Factors on the Regulation of the Yeast Metabolic Cycle: A Multi-Omic Integrative Approach. Frontiers in Genetics - . 2018 L6
Tarazona Campos, Sonia; Sonia Prado-López; Joaquín Dopazo; Alberto Ferrer; Conesa, A.. (2012) Variable Selection for Multifactorial Genomic Data. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 1 (11), 113 - 122. 10.1016/j.chemolab.2011.10.012 2012 L6